17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0362 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0362  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 
156 aa  291  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4948  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  64.1 
 
 
162 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.523973  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1605  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232532  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  25.66 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0650  hypothetical protein  33.61 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125133  normal  0.514619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  26.32 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4709  hypothetical protein  32.88 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.365638  normal  0.665759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5827  hypothetical protein  27.44 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  30.86 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6979  hypothetical protein  28.23 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0377  hypothetical protein  30.86 
 
 
165 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.656327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3289  protein of unknown function DUF1097  30.86 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3306  hypothetical protein  30.86 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  30.06 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00273  predicted inner membrane protein  30.25 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.764997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00276  hypothetical protein  30.25 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5091  hypothetical protein  28.74 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135209  normal  0.26552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>