17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2528 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  100 
 
 		 212 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  46.98 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  38.92 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  36.02 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  33.81 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  35.43 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  25.85 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  24.75 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  30.09 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  25.6 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  26.19 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  27.35 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  29.9 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  28.87 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  25.13 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  24.82 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  33.33 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>