19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1889 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1889  Protein of unknown function DUF372  100 
 
 
117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286212  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1672  hypothetical protein  67.83 
 
 
125 aa  164  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.263499  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1241  hypothetical protein  59.83 
 
 
117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.541142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0831  arginyl tRNA synthetase domain-containing protein  64.15 
 
 
107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0825  hypothetical protein  55.86 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939146  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1332  hypothetical protein  51.4 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0873  hypothetical protein  45.61 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2202  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0295  Protein of unknown function DUF381  44.23 
 
 
129 aa  87  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0062  Protein of unknown function DUF372  39.29 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0126732 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0710  hypothetical protein  39.05 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1256  hypothetical protein  40.19 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1245  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353586  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1430  hypothetical protein  38.1 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0436  Protein of unknown function DUF381  38.74 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0644  hypothetical protein  40.95 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0549662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1827  hypothetical protein  36.94 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2246  Protein of unknown function DUF381  37.5 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0577  Protein of unknown function DUF381  31.58 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>