23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1203 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  57.32 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  59.75 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  53.97 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  42.21 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  41.91 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  41.06 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  35.98 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  36.1 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  33.2 
 
 		 330 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  32.05 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  32.49 
 
 		 350 aa  142  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  31.36 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  31.36 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  32.78 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  31.8 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  30.83 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  29.46 
 
 		 536 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  28.44 
 
 		 536 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  29.46 
 
 		 536 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  26.67 
 
 		 545 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  29.35 
 
 		 536 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>