86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0894 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 433 aa  875    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.04 
 
 		 709 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  31.06 
 
 		 698 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  45.96 
 
 		 697 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.52 
 
 		 954 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  30.06 
 
 		 1035 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  29.71 
 
 		 919 aa  113  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.22 
 
 		 1056 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.34 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  29.11 
 
 		 724 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  56.84 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  48.33 
 
 		 1092 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  58.7 
 
 		 627 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  58.43 
 
 		 735 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.14 
 
 		 1931 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30.46 
 
 		 777 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 		 739 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  62.86 
 
 		 958 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.11 
 
 		 668 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.75 
 
 		 581 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  60.81 
 
 		 387 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  56.16 
 
 		 389 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  50 
 
 		 848 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  61.19 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  58.67 
 
 		 298 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  53.75 
 
 		 930 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50.46 
 
 		 343 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  45.13 
 
 		 564 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  53.16 
 
 		 787 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  55.7 
 
 		 579 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  42.73 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  27.32 
 
 		 635 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  39.1 
 
 		 749 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  48.84 
 
 		 676 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  48.35 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40.8 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  52.08 
 
 		 1001 aa  87  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  60.32 
 
 		 561 aa  86.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  28.49 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  52.86 
 
 		 110 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  48.57 
 
 		 869 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1121 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  52.7 
 
 		 488 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  34.21 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  28.06 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  56.72 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.05 
 
 		 810 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.96 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  52.17 
 
 		 831 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.75 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  46.84 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  50.68 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  35.26 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  36.05 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.51 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.21 
 
 		 735 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  47.95 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  30.19 
 
 		 838 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  34.44 
 
 		 871 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  34.78 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  34.09 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  30.77 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  39.2 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.31 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  28.95 
 
 		 940 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  26.2 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.68 
 
 		 594 aa  67  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  50 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  47.37 
 
 		 883 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  45.61 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  22.45 
 
 		 720 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  29.41 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  52.31 
 
 		 884 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  51.79 
 
 		 960 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  28.43 
 
 		 831 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  26.18 
 
 		 620 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  38.46 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  23.83 
 
 		 805 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.29 
 
 		 820 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  24.44 
 
 		 892 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  30.36 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  26.86 
 
 		 804 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  39.74 
 
 		 975 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  32 
 
 		 1332 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1863  hypothetical protein  45.28 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>