24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0600 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  100 
 
 		 98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  59.18 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  64.58 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  48.45 
 
 		 97 aa  98.6  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  36.67 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  40 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  42.05 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  38.78 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  37.78 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  39.39 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  35.29 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  33.71 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  34.09 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  32.22 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  31.11 
 
 		 106 aa  57  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  32.58 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  31.46 
 
 		 113 aa  57  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1410  SSU ribosomal protein S24E (rps24E)  35.29 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  36.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  28.42 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  29.21 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>