19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0533 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0533  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000671955  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1889  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  50 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.475377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3013  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  44.76 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1975  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  48.54 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.813085  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1485  hypothetical protein  42.06 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000000525267  hitchhiker  0.00254885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1272  putative ribonuclease P subunit RPR2  37.89 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.604634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1510  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0219546  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0421  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.97 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1044  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  41.76 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0214  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  33.33 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125403  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0168  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  35.11 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.736645 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1734  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  34.78 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3200  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  40.45 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0728  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  34.78 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.154027  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1578  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  38.96 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0089  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  44.07 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0560  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  32.38 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1998  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  45.83 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0296724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0943  RNAse P, Rpr2/Rpp21 subunit  36.67 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.941817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>