30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5826 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 		 342 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  77.78 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  56.92 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  56.88 
 
 		 374 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  56.88 
 
 		 369 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  57.81 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  45.19 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  42.43 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  38.98 
 
 		 456 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  33.65 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  39.01 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  36.68 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  38.85 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  37.74 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  37.46 
 
 		 323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  37.42 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  32.22 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  35.64 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  35.64 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.33 
 
 		 380 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  34.81 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.7 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  34.41 
 
 		 779 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  28.47 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.67 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  33.83 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  27.92 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  27.71 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  29.72 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  31.14 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>