63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5567 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5567  protein of unknown function DUF350  100 
 
 		 133 aa  248  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5403  hypothetical protein  86.47 
 
 		 133 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739219  normal  0.527178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4660  hypothetical protein  59.85 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5123  protein of unknown function DUF350  59.85 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331318  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5201  protein of unknown function DUF350  59.85 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4279  hypothetical protein  65.89 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6548  hypothetical protein  52.67 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3913  hypothetical protein  54.2 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.872906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3599  protein of unknown function DUF350  44.96 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3442  hypothetical protein  44.19 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2240  protein of unknown function DUF350  43.94 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3753  hypothetical protein  41.73 
 
 		 133 aa  95.9  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4642  inner membrane protein YjfL  41.13 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4735  inner membrane protein YjfL  39.53 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1221  hypothetical protein  37.78 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4792  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4651  inner membrane protein YjfL  40.32 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4771  inner membrane protein YjfL  39.53 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.888513  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3809  protein of unknown function DUF350  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4655  putative inner membrane protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.698141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5700  putative inner membrane protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.379134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3829  hypothetical protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04013  hypothetical protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4744  putative inner membrane protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4428  putative inner membrane protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04051  conserved inner membrane protein  40.31 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4714  putative inner membrane protein  39.53 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01616  hypothetical protein  38.93 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003908  membrane protein  37.4 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0441  hypothetical protein  39.53 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.933561  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01337  hypothetical protein  34.07 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5046  hypothetical protein  37.7 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5277  protein of unknown function DUF350  36.09 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5549  protein of unknown function DUF350  34.59 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.848106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3782  hypothetical protein  42.62 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4233  protein of unknown function DUF350  35.09 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5365  hypothetical protein  34.59 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4121  protein of unknown function DUF350  35.09 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.580864  normal  0.0514139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2357  hypothetical protein  40.98 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.293162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1696  hypothetical protein  43.44 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02188  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3460  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4892  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.487798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5394  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.593541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3474  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0817  hypothetical protein  35.34 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.082811  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1401  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05342  hypothetical protein  36.28 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.873206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4272  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0575764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0188  hypothetical protein  37.14 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.510986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4799  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1785  protein of unknown function DUF350  30.16 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3303  hypothetical protein  31.43 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1502  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.828357  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3705  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00316212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1314  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00268804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1751  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000355487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1459  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1673  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1487  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1460  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1603  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1640  hypothetical protein  28 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>