14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3102 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3102    100 
 
 		 438 bp  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  85.96 
 
 		 783 bp  347  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  85.96 
 
 		 783 bp  347  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4037    83.01 
 
 		 222 bp  131  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.690709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1237  hypothetical protein  81.77 
 
 		 390 bp  109  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1901  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 474 bp  99.6  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  83.16 
 
 		 840 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  82.35 
 
 		 792 bp  60  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1119    81.63 
 
 		 741 bp  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  48.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000190909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>