25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0955 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  69.1 
 
 		 236 aa  309  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 243 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 		 243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  47.19 
 
 		 244 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  43.59 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  43.81 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  45.09 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  41.1 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  39.38 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  39.38 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  38.77 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  35.41 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  31.73 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  28.63 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0131  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0411  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0714125  normal  0.0851261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>