18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0685 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0685  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1756  hypothetical protein  83.91 
 
 
87 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.886984  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3986  hypothetical protein  77.92 
 
 
84 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00087868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  55.84 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  55.42 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  58.57 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  57.97 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  58.57 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4819  hypothetical protein  70.73 
 
 
84 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402358  normal  0.27545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  55.07 
 
 
87 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4670  hypothetical protein  75.71 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4301  hypothetical protein  75.71 
 
 
99 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.368926  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  55.71 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  44.59 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  36.59 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  31.08 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  29.11 
 
 
88 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  29.11 
 
 
88 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>