15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0590 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4138  phage baseplate assembly protein V  70.22 
 
 		 178 aa  265  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  30 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  30.5 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  27.67 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  27.67 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  29.45 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  27.44 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  31.54 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  27.67 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  25.79 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0682  hypothetical protein  28.9 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  28.95 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  24.76 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1240  hypothetical protein  32.65 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>