23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0483 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  79.18 
 
 
270 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  65.15 
 
 
267 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  62.89 
 
 
271 aa  317  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  43.35 
 
 
259 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  36.9 
 
 
278 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  40.55 
 
 
286 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  39.91 
 
 
304 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  39.91 
 
 
287 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  36.44 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  32.38 
 
 
264 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  35.87 
 
 
241 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  34.25 
 
 
263 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  26.15 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  27.84 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  32.35 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  27.27 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  31.79 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  26.32 
 
 
198 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  25.3 
 
 
231 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  25.49 
 
 
183 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  23.91 
 
 
189 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>