30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2916 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2916  rare lipoprotein B precursor  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2985  Rare lipoprotein B  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00599  hypothetical protein  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0610  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00711824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0661  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0110358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00610  minor lipoprotein  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0274387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0667  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000932859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0693  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.03 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00387404  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.03 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3004  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00131027  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.75 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0730  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0031107  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0690  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0364606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0750  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.760741  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0807  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.914545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0763  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447901  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0704  LPS-assembly lipoprotein RlpB  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.712434  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  24.83 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.47 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  29.1 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  27.78 
 
 
185 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.79 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  37.29 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  23.31 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  23.31 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  24.54 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  24.54 
 
 
206 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  29.07 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  30.14 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  31.34 
 
 
185 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>