17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1338 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1338  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  243  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  hitchhiker  0.0000834558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4062  hypothetical protein  75.21 
 
 
117 aa  194  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1487  hypothetical protein  75.21 
 
 
117 aa  191  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00715013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2168  hypothetical protein  73.5 
 
 
117 aa  191  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2081  hypothetical protein  72.65 
 
 
117 aa  183  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1508  hypothetical protein  70.94 
 
 
117 aa  183  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0198  hypothetical protein  67.52 
 
 
117 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5272  hypothetical protein  69.23 
 
 
117 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16980  hypothetical protein  72.73 
 
 
117 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.993879  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1477  hypothetical protein  72.73 
 
 
117 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5182  hypothetical protein  68.38 
 
 
117 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535352  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5324  hypothetical protein  67.52 
 
 
117 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0635702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0243  hypothetical protein  70.91 
 
 
117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0233  hypothetical protein  63.25 
 
 
117 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0099  hypothetical protein  61.54 
 
 
135 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5528  hypothetical protein  60.68 
 
 
117 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3013  hypothetical protein  64.96 
 
 
117 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>