18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5399 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1558    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1558    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  69.82 
 
 		 811 aa  1013    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  99.88 
 
 		 809 aa  1556    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  68.89 
 
 		 804 aa  1014    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  64.18 
 
 		 802 aa  913    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  41.02 
 
 		 831 aa  447  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  38.16 
 
 		 905 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  33.93 
 
 		 764 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  30.89 
 
 		 706 aa  241  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  39.84 
 
 		 784 aa  75.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  35.56 
 
 		 873 aa  67.8  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  32.18 
 
 		 706 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  23.76 
 
 		 713 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  27.83 
 
 		 884 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  26.93 
 
 		 870 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1447  hypothetical protein  26.32 
 
 		 733 aa  47.8  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  30.05 
 
 		 820 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>