22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0947 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0947  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1194    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0965  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  1194    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1680  hypothetical protein  70.14 
 
 
618 aa  775    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0955  hypothetical protein  85.71 
 
 
588 aa  1018    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690545  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4772  hypothetical protein  63.17 
 
 
584 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.389594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6511  hypothetical protein  38.07 
 
 
587 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1273  hypothetical protein  32.8 
 
 
591 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722393  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3471  hypothetical protein  32.28 
 
 
642 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.515969  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  30.94 
 
 
612 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2950  hypothetical protein  28.95 
 
 
596 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3208  hypothetical protein  28.48 
 
 
624 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.715837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0752  hypothetical protein  28.48 
 
 
647 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0297875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2908  hypothetical protein  28.55 
 
 
617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4224  hypothetical protein  26.91 
 
 
566 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0769  hypothetical protein  27.43 
 
 
619 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0456  hypothetical protein  30.05 
 
 
604 aa  123  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0992  hypothetical protein  27.2 
 
 
585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3020  hypothetical protein  28.9 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.216512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0838  hypothetical protein  26.08 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.351988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1559  hypothetical protein  25.13 
 
 
716 aa  97.8  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1066  hypothetical protein  27.46 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0500  Molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  32.26 
 
 
213 aa  44.3  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>