16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2763 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2763  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1242  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  270  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451086  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2598  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  270  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0236117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2912  hypothetical protein  99.26 
 
 
135 aa  270  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.887727  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1307  hypothetical protein  54.62 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.478307  normal  0.112678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2067  hypothetical protein  54.62 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169668  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2838  hypothetical protein  51.54 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.584129 
 
 
-
 
NC_003296  RS03910  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2651  hypothetical protein  38.71 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0841  hypothetical protein  36.22 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3218  hypothetical protein  37.1 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.648594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3226  hypothetical protein  36.59 
 
 
127 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000034976 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595251  hitchhiker  0.0010958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2070  hypothetical protein  36.22 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1705  hypothetical protein  39.77 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0134218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3625  hypothetical protein  24.79 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>