20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1440 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 102 aa  199  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 103 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  96.7 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  76.92 
 
 		 100 aa  144  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  55.88 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  47.19 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  43.96 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  42.27 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  41.18 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  34.38 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  41.18 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  39.6 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  41.41 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  48.68 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  35.71 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  39.36 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  36.26 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  33.33 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  30.69 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>