17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1403 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1403  GTP cyclohydrolase III  100 
 
 		 266 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0505  GTP cyclohydrolase III  98.5 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1233  GTP cyclohydrolase III  95.86 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0458897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1393  GTP cyclohydrolase III  89.47 
 
 		 266 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0818  GTP cyclohydrolase III  75.3 
 
 		 272 aa  393  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.755555  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2633  GTP cyclohydrolase IIa  46.44 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.808385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3329  GTP cyclohydrolase IIa  45.31 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1598  GTP cyclohydrolase IIa  42.86 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1998  GTP cyclohydrolase III  43.88 
 
 		 268 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2188  GTP cyclohydrolase III  39.68 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0683488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1614  GTP cyclohydrolase IIA  30.42 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1743  GTP cyclohydrolase IIA  25.7 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0670897 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0384  GTP cyclohydrolase IIA  23.33 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1377  GTP cyclohydrolase IIa  25.52 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0982803  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1123  GTP cyclohydrolase IIA  25 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1351  GTP cyclohydrolase IIA  22.76 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0394455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0049  GTP cyclohydrolase IIA  23.85 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0787957  normal  0.474293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>