16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0737 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  91.28 
 
 
447 aa  792    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  875    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  90.83 
 
 
447 aa  789    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  67.34 
 
 
444 aa  615  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  38.43 
 
 
437 aa  279  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  39.76 
 
 
976 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  34.83 
 
 
312 aa  54.3  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  41.67 
 
 
712 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  38.46 
 
 
754 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0324  S-layer protein  25.15 
 
 
531 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  38.89 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  38.89 
 
 
718 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1588  S-layer protein  31.45 
 
 
532 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.733203  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1038  S-layer protein  33.82 
 
 
535 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  33.82 
 
 
1336 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0649  S-layer protein  31.94 
 
 
561 aa  43.5  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>