22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1442 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1442  HAD family hydrolase  100 
 
 
131 aa  250  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0477  HAD family hydrolase  91.6 
 
 
149 aa  235  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0341937  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0360  hypothetical protein  90.55 
 
 
127 aa  220  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.171021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0545  HAD family hydrolase  71.93 
 
 
114 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0908352  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0725  HAD family hydrolase  61.07 
 
 
149 aa  153  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1184  hypothetical protein  40.74 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2830  HAD family hydrolase  40.74 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1135  hypothetical protein  37.96 
 
 
155 aa  93.6  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1711  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000195986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25270  soluble P-type ATPase  37.59 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0968329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0593  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0830  soluble P-type ATPase  38.52 
 
 
156 aa  86.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2299  hypothetical protein  41.04 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0021594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1112  hypothetical protein  34.29 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00144751  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1047  hypothetical protein  36.23 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0282  hypothetical protein  37.68 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1180  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1236  hypothetical protein  35.97 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0027  hypothetical protein  32.84 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0424  hypothetical protein  32.84 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81178  aminophospholipid translocase and ATPase  35.21 
 
 
1513 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.541089 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85147  phopholipid transporting ATPase  36.36 
 
 
1669 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>