18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1002 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  100 
 
 
321 aa  639    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0943  flagella protein  95.33 
 
 
317 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.921753  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1737  flagella protein  82.91 
 
 
304 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  74.85 
 
 
337 aa  476  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0262  flagella protein  51.97 
 
 
295 aa  142  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.377793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  47.41 
 
 
135 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  47.41 
 
 
135 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0971  flagella protein  47.41 
 
 
135 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  47.41 
 
 
135 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  28.4 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  39.29 
 
 
136 aa  86.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  34.55 
 
 
706 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  27.21 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  29.67 
 
 
620 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  31.68 
 
 
573 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  27.97 
 
 
162 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  31.37 
 
 
114 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  30.34 
 
 
165 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>