20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0468 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 102 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  96.7 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  76.92 
 
 		 100 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  55.34 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  45.54 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  43.96 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  41.18 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  42 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  34.69 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  40.78 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  40.82 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  42.86 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  38 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  34.74 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  36.26 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  32.99 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  30.69 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>