18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0350 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0350  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0261657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1561  hypothetical protein  96 
 
 
200 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.222992 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1065  hypothetical protein  95 
 
 
200 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1696  hypothetical protein  78.5 
 
 
200 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1053  hypothetical protein  44.92 
 
 
209 aa  142  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.262848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0452  hypothetical protein  29.55 
 
 
307 aa  59.3  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0103464  normal  0.401357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2705  hypothetical protein  29.73 
 
 
296 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.878489  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1008  putative phosphoserine phosphatase  30.51 
 
 
286 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0742  hypothetical protein  30.82 
 
 
293 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.907008  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1093  phosphoserine phosphatase  26.26 
 
 
285 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.961798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2613  hypothetical protein  26.52 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1403  putative phosphoserine phosphatase  31.85 
 
 
286 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000306839  normal  0.300819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1450  putative phosphoserine phosphatase  28.3 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3079  hypothetical protein  26.97 
 
 
296 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.920987  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0293  putative phosphoserine phosphatase  26.59 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202357  normal  0.275422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0936  phosphoserine phosphatase  25.4 
 
 
285 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0943  putative phosphoserine phosphatase  28.73 
 
 
286 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.458027  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1357  putative phosphoserine phosphatase  28.11 
 
 
294 aa  42  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00112644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>