17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1736 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  100 
 
 
135 aa  270  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  96.3 
 
 
135 aa  261  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  96.3 
 
 
135 aa  261  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0971  flagella protein  92.59 
 
 
135 aa  255  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  58.09 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  48.74 
 
 
337 aa  114  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  47.41 
 
 
321 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0943  flagella protein  46.55 
 
 
317 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.921753  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1737  flagella protein  44.83 
 
 
304 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  37.29 
 
 
428 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0262  flagella protein  34.4 
 
 
295 aa  91.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.377793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  35.9 
 
 
706 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  27.08 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  28.72 
 
 
162 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  32 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  27 
 
 
573 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0493  fla cluster protein FlaD  32.18 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.990936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>