19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1430 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1430  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  247  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0710  hypothetical protein  92.74 
 
 
124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1245  hypothetical protein  91.13 
 
 
124 aa  228  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.353586  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1256  hypothetical protein  77.78 
 
 
126 aa  197  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0644  hypothetical protein  63.87 
 
 
121 aa  154  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0549662  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0295  Protein of unknown function DUF381  46.96 
 
 
129 aa  103  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2202  hypothetical protein  41.96 
 
 
122 aa  94.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0873  hypothetical protein  42.34 
 
 
131 aa  90.5  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0436  Protein of unknown function DUF381  39.5 
 
 
124 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0825  hypothetical protein  41.28 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.939146  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1332  hypothetical protein  43.4 
 
 
108 aa  84  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1241  hypothetical protein  38.46 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.541142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1889  Protein of unknown function DUF372  38.1 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286212  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0062  Protein of unknown function DUF372  40.57 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0126732 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0577  Protein of unknown function DUF381  39.32 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0831  arginyl tRNA synthetase domain-containing protein  42.31 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1672  hypothetical protein  36.94 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.263499  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1827  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2246  Protein of unknown function DUF381  36.89 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>