25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0999 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  94.96 
 
 
536 aa  1011    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  96.46 
 
 
536 aa  1027    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  59.18 
 
 
545 aa  646    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  73.51 
 
 
536 aa  823    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1077    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  34.48 
 
 
323 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  32.59 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  34.88 
 
 
314 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  34.5 
 
 
350 aa  150  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  33.55 
 
 
350 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  33.22 
 
 
350 aa  140  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  31.49 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  30.46 
 
 
316 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  30.03 
 
 
316 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  32.23 
 
 
317 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  29.53 
 
 
322 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  30 
 
 
271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  32.75 
 
 
248 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  32.2 
 
 
252 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  25.2 
 
 
252 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  29.46 
 
 
250 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  29.46 
 
 
248 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  97.8  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  28.69 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  22.71 
 
 
374 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>