14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0505 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0505  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.620717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0777  hypothetical protein  22.88 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2979  hypothetical protein  25.91 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3123  hypothetical protein  25.91 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5238  hypothetical protein  20.85 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2333  hypothetical protein  26.19 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.132174  normal  0.560629 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5114  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.29 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00672  hypothetical protein  23.85 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3042  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.79 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1960  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.34 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244976  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1173  hypothetical protein  21.61 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1516  hypothetical protein  22.22 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2016  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  18.73 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0529059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1567  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  21.12 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>