32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2143 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  649    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  43.63 
 
 
456 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  40 
 
 
335 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  36.92 
 
 
369 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  37.19 
 
 
361 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  36.92 
 
 
374 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  34.43 
 
 
334 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  35.56 
 
 
328 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  36.39 
 
 
349 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  31.52 
 
 
334 aa  145  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  33.98 
 
 
339 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  37.12 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  35.35 
 
 
323 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  33.44 
 
 
321 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  37.09 
 
 
342 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  28.35 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  31.9 
 
 
319 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  31.9 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.74 
 
 
380 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  32.3 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  30.19 
 
 
779 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.34 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.36 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.21 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  26.36 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  27.86 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  29.71 
 
 
395 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0656  hypothetical protein  22.03 
 
 
298 aa  53.5  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.92 
 
 
350 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  30.09 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  35.59 
 
 
331 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  28.4 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>