18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2038 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2038  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  696    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0866  hypothetical protein  25.65 
 
 
406 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3152  hypothetical protein  34.62 
 
 
466 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.416399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0582  hypothetical protein  25.21 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4814  hypothetical protein  25.6 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0511  hypothetical protein  38.04 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1312  hypothetical protein  34.07 
 
 
347 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.667333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2336  hypothetical protein  27.17 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0899485  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4660  hypothetical protein  19.87 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12173  hypothetical protein  34.74 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6305  hypothetical protein  22.8 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0582  hypothetical protein  32.09 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0242426  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2578  hypothetical protein  35.24 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.149067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0075  hypothetical protein  38.67 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1943  hypothetical protein  27.01 
 
 
428 aa  53.9  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1391  hypothetical protein  20.91 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0978  hypothetical protein  32.56 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2453  hypothetical protein  34.09 
 
 
233 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.438658  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>