20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1984 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1984  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2569  hypothetical protein  28.19 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2718  hypothetical protein  27.52 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1229  protein of unknown function DUF1131  27.52 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2804  hypothetical protein  27.52 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3662  hypothetical protein  26.85 
 
 
191 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2587  hypothetical protein  26.85 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3459  hypothetical protein  27.15 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1247  hypothetical protein  26.85 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.785761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02332  hypothetical protein  26.85 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02294  hypothetical protein  26.85 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2953  hypothetical protein  26.03 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848863  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2707  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0763  hypothetical protein  25.63 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2592  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1000  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2813  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.749922  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2683  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2641  hypothetical protein  28.76 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3284  hypothetical protein  26.35 
 
 
202 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>