12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1824 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1824  ABC transporter protein, putative  100 
 
 
241 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.249165  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2201  hypothetical protein  25.56 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00824673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2404  permease  25.79 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2405  hypothetical protein  25.4 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0927  permease; MrsE protein  27.67 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0910  ABC transporter permease  28.3 
 
 
248 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23700  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1437  hypothetical protein  27.85 
 
 
262 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.621296  normal  0.808142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3872  hypothetical protein  25.3 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05790  hypothetical protein  28.73 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.782546  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0158  hypothetical protein  30.48 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.181682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4012  hypothetical protein  26.48 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.35739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>