33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1075 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 207 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  37.37 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  37.89 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  37.37 
 
 		 207 aa  121  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  39.77 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  38.15 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  37.3 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  36.9 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  34.01 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  38.04 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  36.31 
 
 		 203 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  35.59 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  35.59 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  36.21 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  33.89 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  36.16 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  35.63 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  35.03 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  30.2 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  30.11 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  28.32 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  26.79 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  25.75 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  24.26 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  23.84 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  24.44 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  24.71 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3112  type IV pilus assembly PilZ  38.18 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  27.22 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>