18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2685 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2685  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  hitchhiker  0.000194293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3642  hypothetical protein  44.38 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0214  hypothetical protein  47.29 
 
 
170 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3887  hypothetical protein  41.92 
 
 
173 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1309  hypothetical protein  41.57 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000696984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4102  hypothetical protein  40.96 
 
 
173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4580  hypothetical protein  42 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1402  hypothetical protein  38.31 
 
 
180 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156265  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0542  hypothetical protein  34.13 
 
 
173 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47320  hypothetical protein  37.8 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4083  hypothetical protein  37.8 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3908  hypothetical protein  33.54 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1577  hypothetical protein  32.87 
 
 
174 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1785  hypothetical protein  38.33 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0605604  normal  0.726112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1089  hypothetical protein  24.83 
 
 
169 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.429336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3197  hypothetical protein  24.14 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.367183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1102  hypothetical protein  24.14 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1193  hypothetical protein  23.45 
 
 
170 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>