12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1516 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  34.86 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  28.15 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  28.62 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  25.34 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  25.52 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  28.62 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  30.1 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  25.96 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  27.5 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  32.52 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>