93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1438 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  53.42 
 
 
186 aa  160  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  45.09 
 
 
208 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  41.99 
 
 
175 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  40.12 
 
 
171 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  43.48 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  45.56 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  40.23 
 
 
174 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  44.03 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  43.27 
 
 
172 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  42.35 
 
 
176 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  40.45 
 
 
175 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  40.88 
 
 
180 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  36.63 
 
 
169 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  40.83 
 
 
169 aa  141  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  41.42 
 
 
169 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  40.12 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  44.1 
 
 
188 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  37.87 
 
 
169 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  40.24 
 
 
169 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  40.24 
 
 
169 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  37.72 
 
 
169 aa  136  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  40.72 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  40.24 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  40.72 
 
 
169 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  40.72 
 
 
169 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  40.72 
 
 
169 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  40.83 
 
 
169 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  39.08 
 
 
174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  35.93 
 
 
167 aa  129  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  37.87 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  38.55 
 
 
168 aa  128  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  37.72 
 
 
169 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  37.65 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  37.11 
 
 
168 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  36.75 
 
 
168 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  36.42 
 
 
179 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  43.48 
 
 
185 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  38.15 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  36.71 
 
 
159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  45.11 
 
 
178 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  38.22 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  37.96 
 
 
163 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  34.46 
 
 
198 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  36.14 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  31.25 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  34.36 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  34.73 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  33.15 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  30.99 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  32.32 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  37.67 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  32.92 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  31.97 
 
 
147 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  31.97 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  29.61 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  37.12 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  29.85 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  31.15 
 
 
191 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  32.14 
 
 
178 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  31.08 
 
 
171 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  38.39 
 
 
149 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  32.17 
 
 
160 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  37.7 
 
 
146 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  31.58 
 
 
160 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  34.38 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  34.26 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  33.94 
 
 
160 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  27.91 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  33.91 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  27.92 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  27.74 
 
 
160 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  32.23 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  25.91 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  29.82 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  35.96 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  29.63 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  30.14 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  29.17 
 
 
168 aa  48.9  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  25.79 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  28 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  29.07 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  29.87 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  29.87 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  24.69 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  25.35 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  35.34 
 
 
165 aa  41.2  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>