15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1343 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  37.44 
 
 
213 aa  141  9e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  36.02 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  37.27 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  30.37 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  38.71 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  23.48 
 
 
239 aa  52  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  25.25 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  26.76 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  23.78 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  23.33 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  23.5 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  25 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  25.51 
 
 
231 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  23.4 
 
 
235 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>