19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0655 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  100 
 
 
97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  51.04 
 
 
97 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  48.45 
 
 
98 aa  98.6  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  51.04 
 
 
99 aa  97.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  44.21 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  37.78 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  38.64 
 
 
101 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  34.44 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  32.29 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  35.56 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  30 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  31.91 
 
 
103 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  30.69 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 
103 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  26.67 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  34.69 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  27.84 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>