17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2280 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  100 
 
 		 213 aa  442  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  34.27 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  33.81 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  34.58 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  30.37 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  24.55 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  28.93 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  22.35 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  22.35 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  25.76 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  26.42 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  24.24 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  26.51 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  20.75 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  21.8 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  26.7 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  24.32 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>