25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2259 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2259  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0291  Ribonuclease R winged-helix domain protein  64.33 
 
 
316 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0321782  normal  0.500611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0526  hypothetical protein  62.54 
 
 
317 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.312307 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0555  ribonuclease R winged-helix domain-containing protein  56.05 
 
 
322 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1076  hypothetical protein  38.16 
 
 
323 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1780  Protein of unknown function DUF128  36 
 
 
330 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1647  hypothetical protein  35.94 
 
 
324 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0669  hypothetical protein  32.89 
 
 
314 aa  178  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00126018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_834  hypothetical protein  31.56 
 
 
350 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.245563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0961  hypothetical protein  31.56 
 
 
350 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0852  hypothetical protein  30.63 
 
 
350 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.358911  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0218  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  142  8e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0285  hypothetical protein  31.46 
 
 
536 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1629  hypothetical protein  30.46 
 
 
536 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1504  hypothetical protein  30.26 
 
 
252 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0999  hypothetical protein  30.46 
 
 
536 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.51453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1751  hypothetical protein  31.97 
 
 
252 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000678533  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1479  hypothetical protein  33.2 
 
 
536 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.711072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2327  hypothetical protein  33.19 
 
 
248 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.808055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1203  Protein of unknown function DUF128  31.36 
 
 
250 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.991646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2599  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1790  Ribonuclease R winged-helix domain protein  28.73 
 
 
332 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1470  hypothetical protein  27.71 
 
 
271 aa  98.6  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.284851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0488  hypothetical protein  26.89 
 
 
248 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.105289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1785  Ribonuclease R winged-helix domain protein  24.48 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>