50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3929 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3929  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056579  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2471  hypothetical protein  87 
 
 
236 aa  341  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2195  hypothetical protein  79.59 
 
 
221 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2241  hypothetical protein  79.59 
 
 
221 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0569668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2184  hypothetical protein  79.59 
 
 
221 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  hitchhiker  0.00922268 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12708  hypothetical protein  65.37 
 
 
223 aa  226  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0664757  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2255  hypothetical protein  55.74 
 
 
223 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24230  hypothetical protein  52.91 
 
 
270 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.60384  normal  0.0961367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1519  hypothetical protein  50.81 
 
 
272 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5226  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  54.35 
 
 
206 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5314  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  54.35 
 
 
206 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5606  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  54.35 
 
 
206 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.259216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2125  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  47.28 
 
 
223 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1887  integral membrane alanine and leucine rich protein  46.32 
 
 
215 aa  157  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4236  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  47.28 
 
 
227 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3758  hypothetical protein  41.67 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000411746  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1321  hypothetical protein  45.6 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5193  hypothetical protein  42.16 
 
 
271 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1639  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1449  hypothetical protein  38.22 
 
 
223 aa  99  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.301993  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3309  hypothetical protein  35.64 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0382594  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1484  hypothetical protein  37.11 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205776  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4529  hypothetical protein  32.26 
 
 
237 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1080  hypothetical protein  32.98 
 
 
256 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.0894269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1875  hypothetical protein  33.48 
 
 
280 aa  85.1  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0260  hypothetical protein  33.16 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1560  hypothetical protein  36.69 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1407  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0492  hypothetical protein  29.1 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.165754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2287  hypothetical protein  32.95 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2876  hypothetical protein  31.75 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0620073  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1632  hypothetical protein  31.89 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1709  hypothetical protein  35.68 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0885217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2956  hypothetical protein  31.35 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286801  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6761  hypothetical protein  28.65 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1639  hypothetical protein  31.35 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14520  hypothetical protein  30.93 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2576  hypothetical protein  29.45 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3179  hypothetical protein  30.27 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0388  hypothetical protein  31.94 
 
 
248 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1932  hypothetical protein  35.51 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.748587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1706  hypothetical protein  34.72 
 
 
257 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0678311  normal  0.108804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1919  hypothetical protein  30.32 
 
 
260 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34720  hypothetical protein  30.62 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105852  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15770  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0917731  normal  0.361516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13090  hypothetical protein  34.3 
 
 
234 aa  54.7  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3908  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.91 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16150  hypothetical protein  39.39 
 
 
265 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.596179  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2905  hypothetical protein  25.77 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3294  hypothetical protein  27.27 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900451  normal  0.652925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>