25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3762 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4057  hypothetical protein  97.69 
 
 
433 aa  848    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4018  hypothetical protein  90.85 
 
 
437 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142082  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3762  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  886    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.21345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4395  hypothetical protein  55.88 
 
 
436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2299  hypothetical protein  54.89 
 
 
436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2629  hypothetical protein  53.32 
 
 
436 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3526  hypothetical protein  45.2 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1987  petrobactin biosynthesis protein AsbE  39.3 
 
 
327 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3342  petrobactin biosynthesis protein AsbE  38.98 
 
 
327 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000187753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1842  hypothetical protein  38.05 
 
 
331 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2020  petrobactin biosynthesis protein AsbE  38.05 
 
 
327 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2338e-44 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1985  hypothetical protein  38.05 
 
 
327 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1816  hypothetical protein  38.05 
 
 
331 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1799  hypothetical protein  37.74 
 
 
331 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1848  hypothetical protein  37.58 
 
 
334 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3525  hypothetical protein  44.74 
 
 
89 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.588377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1847  acyl carrier protein  39.19 
 
 
91 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1984  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1798  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2019  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04545e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1841  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1815  acyl carrier protein  35.14 
 
 
89 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.049961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3343  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.812241  hitchhiker  0.00000000000000639555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1986  acyl carrier protein  35.14 
 
 
91 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.917362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
1557 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>