37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3086 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3406  catalase  95.05 
 
 		 364 aa  704    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  100 
 
 		 364 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  55.28 
 
 		 360 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  55.28 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  51.99 
 
 		 457 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  51.68 
 
 		 455 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  47.75 
 
 		 362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  45.07 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  44.79 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  44.04 
 
 		 362 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  43.58 
 
 		 370 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  44.66 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  44.62 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  44.38 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  44.1 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  43.18 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  41.62 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  40.5 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  41.23 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  39.83 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  40.23 
 
 		 362 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  40.11 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  38.12 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  36.62 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  35.45 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  32.42 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  35.31 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  26.33 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  28.73 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  31.76 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  26.97 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  30.2 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  29.89 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  29.6 
 
 		 379 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  31.19 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  28.8 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  24.32 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>