30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3033 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  98.98 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  86.39 
 
 		 191 aa  330  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  46.37 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  32.34 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  32.34 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  30.54 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  30.54 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  31.65 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  30.38 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  25.97 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  25.66 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  26.32 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  26.45 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  25.32 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  29.55 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  26.97 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  27.33 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  23.08 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  24.24 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  26.87 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  46.05 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  23.84 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  24 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  25.38 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>