14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1370 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1370  hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1370    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.103555  normal  0.0562053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0272  hypothetical protein  71.98 
 
 		 669 aa  869    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.937532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1315  hypothetical protein  91.91 
 
 		 678 aa  1171    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1570  hypothetical protein  98.78 
 
 		 654 aa  1293    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3738  hypothetical protein  74.73 
 
 		 664 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0104  hypothetical protein  52.36 
 
 		 982 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4802  hypothetical protein  48.13 
 
 		 652 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.653605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4796  hypothetical protein  47.96 
 
 		 622 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308009  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5211  hypothetical protein  34.76 
 
 		 705 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5538  cellulose synthesis protein  32.94 
 
 		 760 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1296  hypothetical protein  31.06 
 
 		 791 aa  195  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1207  hypothetical protein  30.47 
 
 		 799 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.907173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4176  hypothetical protein  28.24 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0965  hypothetical protein  29.79 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>