31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1091 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  99.46 
 
 		 374 aa  732    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  89.43 
 
 		 361 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  733    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  73.38 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  57.69 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  56.88 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  43.67 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  36.92 
 
 		 318 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  38.56 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  32.21 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  33.64 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  35.74 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  36.51 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  33.97 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  33.98 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  33.98 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  32.82 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  36.23 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  29.25 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  36.33 
 
 		 779 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.69 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.09 
 
 		 366 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.49 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  27.42 
 
 		 309 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  29.81 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  31.58 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  26.22 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  30.03 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0799  hypothetical protein  27.31 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  30.07 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.44 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>