42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0869 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  97.8 
 
 		 364 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  739    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  89.29 
 
 		 364 aa  632  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  75.21 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  59.21 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  59.71 
 
 		 362 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  56.21 
 
 		 381 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  54.7 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  54.7 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  54.49 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  50.56 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  50.57 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  47.06 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  45.07 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  47.21 
 
 		 455 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  44.51 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  44.44 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  41.98 
 
 		 360 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  41.11 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  43.94 
 
 		 362 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  41.85 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  37.64 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  40.34 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  35.8 
 
 		 388 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  34.59 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  30.06 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  31.65 
 
 		 401 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  33.88 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  31.32 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  30.43 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  30.32 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  26.88 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  30.34 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  29.06 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  30.82 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  27 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  24.02 
 
 		 482 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06020  CAT1 catalase, putative  23.26 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  25.22 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  27.97 
 
 		 710 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  22.52 
 
 		 480 aa  43.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>