24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0667 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0667  thiamineS protein  100 
 
 
84 aa  165  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0221  thiamineS protein  70.24 
 
 
84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.264709  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0602  thiamineS protein  69.05 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.121924  normal  0.769376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1316  thiamineS protein  69.05 
 
 
84 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5690  thiamineS protein  27.06 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669333 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6448  thiamineS protein  27.06 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01049  molybdopterin converting factor, small subunit  31.46 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.286152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  33.72 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  28.24 
 
 
81 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6963  thiamine S  27.06 
 
 
85 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0838  molybdopterin synthase small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  27.06 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.07 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>